Tiểu thuyết Shogun Tướng Quân là câu chuyện xoay quanh nhân vật Blackthorne – một hoa tiêu người Anh đã mạo hiểm lái con tàu chiến Erasmus và thuỷ thủ đoàn đến Nhật Bản bằng con đường xuyên Thái Bình Dương. Anh và mọi người bị bắt và bị sốc trước những con người Nhật Bản thấp bé mà mạnh mẽ, lạnh lùng và khó hiểu. Từ vị trí của tù nhân, nhờ vào sự mưu trí, tài năng, lòng dũng cảm, Backthorne dần chiếm được tình cảm của lãnh chúa là Toranaga và bị cuốn vào âm mưu chiến tranh Toranaga.